В 2007 году был опубликован ежедневник, который вел командующий военно-морскими силами Турции Озден Орнек. Журналисты утверждали, что командующему морскими силами не нравилась политика, проводимая "Партией справедливости и развития". В 2003-2004 годах якобы планировались перевороты, которые не удалось осуществить из-за противодействия тогдашнего начальника генерального штаба Хилми Озкёка.
Серьезные доказательства существования "Эргенекона" начали добываться после 2007 года. В деревне на крыше обычного частного дома были найдены 27 ручных гранат. В компьютере арестованного в связи с этим делом сержанта были найдены документы о лоббировании гражданских компонентов "Эргенекона". С этого дела началась волна расследований, в рамках которых были задержаны десятки человек, среди которых были и высокопоставленные военные, например, бывший министр обороны Махмут Озтюрк. При задержаниях многих подозреваемых в связях с организацией обнаруживалось оружие и боеприпасы.
Власти были явно обеспокоены масштабами сети и количеством участвующих в ней высокопоставленных персон. Лидером организации считался отставной бригадный генерал Вели Кючук, который был арестован в рамках крупномасштабной операции правоохранительных органов 22 января 2008 года. Казалось, арестовывают всех подряд. Отставные генералы, командующие армиями, полицейские, писатели и даже ректоры вузов.
Масштабы заговора действительно впечатляют. Но если знать ситуацию в Турции, то нет ничего удивительного. Армия протестует против снижения своего веса и влияния в стране. В новейшей истории страны было пять переворотов, и всегда узел власти в своих руках держали военные. А сейчас происходит по сути революция, когда власть уходит из рук военных к гражданскому правительству. Мало того, страна стремительно возвращается к своим исламским корням. Все происходящее нельзя назвать исламской революцией, но военные всегда активно выступали за светский характер государства, и в этом смысле были активными продолжателями курса создателя современного турецкого государства Кемаля Ататюрка.
Тактика заговорщиков была предельно простой - организовывать теракты, убивать людей, чтобы сеять хаос. Все это делалось для подрыва авторитета властей в стране и для того, чтобы была возможность заявить, что государство не справляется со своими функциями. Считается, что только из этих соображений был убит, например, известный турецкий журналист армянского происхождения Грант Динк.
Все это позволило бы обосновать готовящийся переворот и убедить общество в том, что стране необходима радикальная смена политического курса.
Проект не удался. Расследование в суде так и не окончено. В деле огромное количество фигурантов, свыше 300 человек. И периодически происходят все новые и новые задержания.